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dafa888:现有碱基编辑器只能实现嘧啶与嘧啶之间

时间:2021/1/13 12:40:50   作者:   来源:   阅读:0   评论:0
内容摘要:中国科学院天津工业生物技术研究所张学利研究员带领的微生物代谢工程研究团队和毕昌浩研究员带领的合成生物技术研究团队共同攻克了关键问题,设计并构建了胞嘧啶脱氨酶-ncas9-ung蛋白复合物,碱基酶碱基编辑器(GBE)已经开发出一种单碱基基因编辑系统,可以在嘧啶和嘌呤之间进行转换。基于该系统,世界上首次实现了微生物中的任意...

中国科学院天津工业生物技术研究所张学利研究员带领的微生物代谢工程研究团队和毕昌浩研究员带领的合成生物技术研究团队共同攻克了关键问题,设计并构建了胞嘧啶脱氨酶- ncas9 - ung蛋白复合物,碱基酶碱基编辑器(GBE)已经开发出一种单碱基基因编辑系统,可以在嘧啶和嘌呤之间进行转换。基于该系统,世界上首次实现了微生物中的任意碱基编辑,以及哺乳动物细胞中胞嘧啶(C)和鸟嘌呤(G)的特异性转化。相关研究结果将于2020年12月底发表在杂志上。据报道,现有碱基编辑器只能实现嘧啶与嘧啶之间、嘌呤与嘌呤之间的碱基转换。没有碱基编辑器来实现嘧啶和嘌呤之间的特定碱基转换。传统的胞嘧啶碱基编辑器(CBE)在脱氨酶(AID)作用下,将单链DNA上的C转化为尿嘧啶(U),尿嘧啶经多次DNA复制后转化为胸腺嘧啶(T)。


GBE有独特的方法,利用细胞的DNA修复系统直接修复“非常规基地”,生成特定的基地,并实现基本编辑:把尿嘧啶糖基转移酶())胞嘧啶脱氨酶形成的尿嘧啶基地网站,实验结果表明,GBE碱基编辑器可以将大肠杆菌中的C转化为腺嘌呤(A),平均编辑特异性为93.8%±4.8%,可以实现任意碱基转换。

在哺乳动物细胞中,GBE碱基编辑器可以在N20序列的第6个胞嘧啶(C6)处进行高度特异性的C - G转换。其中30个检测位点和23个位点的CG编辑特异性均大于50%,其中2个位点特异性均大于90%。


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